Zinc-finger nucleases, TALEN, and CRISPR/Cas metody modifikace genomu
Archiv rubriky: Biotechnologie
FollowGMO potraviny
Zprávy odmítačů GMO
GMWatch is an independent organisation that seeks to counter the enormous corporate political power and propaganda of the GMO industry and its supporters.
2000 studií potvrzují bezpečnost GMO potravin
Geneticliteracyproject.org is part of the Science Literacy Project
Zakázané GMO potraviny v Evropě? A co „organická“ pšenice
Záhada růstu případů autismu vyřešena
Simulace molekul
LAMMPS Molecular Dynamics Simulator
Abalone The main application is the modeling of biomolecules, in particular, proteins, lipids, and nucleic acids.
HOOMD-blue is a general-purpose particle simulation GROMACStoolkit. It scales from a single CPU core to thousands of GPUs.
GROMACS is a versatile package to perform molecular dynamics, i.e. simulate the Newtonian equations of motion for systems with hundreds to millions of particles.
Soft litografie
From Micro- to Nanofabrication with Soft Materials
Recent progress in soft lithography
PDMS Isopropanol Microfluidics Stanford Microfluidics Foundry
PDMS microfluid channel
Soft litografie kompletní zařízení od Blackhole lab
DNA od začátku
Děti se podobají rodičům. Proč a jak funguje DNA a genetika?
Mimo buněčná syntéza RNA a proteinů
Cell-free RNA and protein synthesis (CFPS) PLOS
Extrakce DNA
Extrakce DNA názorně na slidech
Extrakce DNA doma pomocí chemikálií běžně dostupných v domácnostech.
Extrakce DNA wiki
qPCR – Real time PCR
Základy qPCR
Jak nastavit qPCR experimenty?
Co se dá dělat s qPCR
qPCR od Chai Bio za 1999USD
Vybavení bio laboratoře z Alibaba
Mikro pipety na Aliexpressu – micropipette
ochranné oděvy chemical suits / safety clothing / protective coverall
Odsávací boxy laboratory fume hoods
Nanotechnologie
Richard Feynma: Dole je hodně místa
Aplikace nanotechnologií v biologii a medicíně
Next generation sequencing
NGS videa
BGI America Human Exome sequencing Coverage (100X) for $599/sample
Co je to? Word of day
Raindance Technologies is developing new “liquid biopsy” systems using tiny droplets separated by oil to analyze DNA.
Přenos látek v buňce
Beta barrel protein
Póry v jádru buňky
Nanopore sequencing přes pory Mycobacterium smegmatis (University of Washington).
OpenPCR
E-knihy
Open Access knihy od Omics Group Int.
Bookboon sponzorované e-knihy
Škoda auto sponzorované e-knihy z bookboon
Přehled čteček na Wikipedii
Gelová elektroforéza
Gelová elektroforéza Wiki
Rozdíl mezi běžným a žraločím hřebenem
OpenWetWare Open gel box
K označení DNA po gelové elektroforéze lze využít osvětlení modrým světlem (bez narušení jako u UV světla) Pearl Biotech Blue Transluminator v ceně 299USD
- Možné barvy
- SYBR Safe
- SYBR Green I
- GelGreen
- GRSafe
- Ethidium Bromide
Přehled a vlastnosti barev na zvýraznění DNA
Srovnání iluminátorů od různých dodavatelů
Boxy na elektroforézu Thermo scientific, Alibaba NanBei
DNA databáze
Iniciativa propojující genové databanky International Nucleotide Sequence Database Collaboration
Japonská DNA Databanka
Volně dostupná data z medicínských výzkumů European Bioinformatics Institute
National Center for Biotechnology Information informační videa
Vzorky bakterií, plísní a virů ATCC ATCC Wikipedia. ATCC je soukromá nezisková organizace zaměřená na uchování biologických vzorků.
SNPs – single nucleotide polymorfismus
SNPedia databáze zjištěných SNP a jejich výskyt v literatuře.
Promethease jednoduchý způsob analýzy SNP např. z dat od 23 and me.
Nástroje pro analýzu surových dat z 23andMe, AncestryDNA nebo Family Tree DNA Family Finder testů.
Human proteome project bílkoviny, enzymy, protilátky.
BEI Resources – bezplatná databáze vzorků virů, bakterií pro výzkum.
Mybiosource.com dodavatel protilátek a ELISA kitů
Biocompare nákupní portál pro humánní medicínu
Enzymy ve výrobě potravin
Doktor House v kapse
50 korunová aplikace pro iPhone a Android s názvem McGraw-Hill Medical’s Diagnosaurus obsahuje kolem tisícovky různých diagnóz, které pomáhájí doktorům k rozpoznání té správné diagnózy.